La version Game Boy Color est un jeu de rôle avec un combat au tour par tour. Le joueur contrôle Harry, à partir du moment où Hagrid l'amène à Diagon Alley. Il suit strictement l'histoire des livres, avec toutes les scènes de ce moment-là dans le livre étant jouable, à l'exception de l'ajout de groupes de monstres tels que des rats, des chauves-souris et des araignées errant la plupart des emplacements. Les sorts sont utilisés pour le combat, plutôt que d'interagir avec l'environnement. De plus, des combinaisons de cartes de sorcières célèbres et de cartes de collection de sorcières célèbres peuvent être utilisées pour produire de puissants effets magiques. Ces cartes peuvent être trouvées partout dans le Poudlard librement explorable.