Année 2011. Cinq ans se sont écoulés depuis la deuxième catastrophe, qui a éclipsé les événements d'avril 1986. La zone est ébranlée par des éruptions fréquentes et puissantes, qui déplacent des champs d'anomalies, ouvrant de nouvelles voies vers des emplacements auparavant inaccessibles. Les factions de harceleur se battent pour les nouveaux territoires et les points clés. Beaucoup de harceleurs meurent, mais les débutants continuent d'arriver. L'action se déroule un an avant les événements de S.T.A.L.K.E.R.: Shadow of Tchernobyl, un an avant le voyage le plus réussi de Strelok au centre de la zone - le troisième. Vous découvrirez Strelok et son équipe du point de vue d'un autre personnage. La zone vous attend à venir, de nouveaux emplacements et des menaces inconnues, des trous spatiaux et des monstres se cachant dans le brouillard, les nuits-noir et les rayons de sauvegarde d'un soleil levant. Essayez d'éviter les anomalies et de se cacher des éruptions, de découvrir la zone et de collecter des artefacts, de guérir l'irradiation radioactive et de se battre pour toute faction de harceleur que vous aimez! Ce n'est qu'alors que vous découvrirez la vérité sur Strelok et comment il est arrivé dans le camion de mort et recevoir le S.T.A.L.K.E.R. tatouage sur son bras.