Le jeu partage son nom avec deux jeux Sonic précédents, un manga, une série télévisée, une série de bandes dessinées et leur personnage principal éponyme. Pour désambiguïter, le jeu a été appelé Sonic 2006. Il a été produit en commémoration du 15e anniversaire de la série Sonic the Hedgehog. Le jeu a été confronté à plusieurs problèmes pendant le développement, ce qui a entraîné la précipitation du produit malgré les bogues existants. Les deux versions ont été fortement critiquées pour des temps de chargement longs, un système de caméra médiocre, des problèmes de gameplay, une parcelle compliquée et un contrôle des personnages bâclé. Le jeu a été confronté à des problèmes de développement, ce qui a entraîné la précipitation du produit et, finalement, un mauvais produit est livré. À la sortie, il a été largement critiqué pour ses nombreux problèmes de jeu, ses longues temps de chargement et son complot compliqué.