The Legend of Zelda: Majora's Mask 3D est un remake du jeu Nintendo 64 original avec des graphiques plus à jour, une interface utilisateur rationalisée et différents modes de jeu supplémentaires. La plupart des textures sont beaucoup plus détaillées, et de nombreux modèles sont plus fidèles au concept et à l'art promotionnel du jeu. De plus, la fréquence d'images a été augmentée à 30 ips par rapport aux 20 ips d'origine.