Cette version du jeu a une approche similaire à l'entrée précédente, avec Poudlard étant un monde ouvert que vous pouvez explorer à votre guise entre les niveaux nécessaires pour faire avancer l'histoire. Le grand changement cette fois est que Ron et Hermione ont été promus jouables, ce qui vous permet de jouer comme les trois membres du trio. Ils ont chacun des capacités différentes et, selon la plate-forme, vous pouvez ou ne pouvez pas décider quand changer de caractères. Une autre différence est que Quidditch n'est plus jouable, avec des vols sur Buckbeak le remplaçant pour le mécanicien de vol requis. Peut-être que le matériel source est plus émotionnel et moins orienté vers l'action, les stations du canon sont principalement écrémées.