Utilisant l'ensemble de règles de Dungeons & Dragons de la 3e édition, Baldur's Gate : Dark Alliance II propose quatre nouveaux actes de combat hack-and-slash et de puissants sorts. Encore plus de types de monstres s'engageront dans des batailles en temps réel en utilisant la même perspective aérienne que celle du jeu original. Chaque personnage sélectionné peut mettre à profit l'expérience acquise au combat pour acquérir de nouveaux exploits et des capacités améliorées au fil du temps. Pour vous aider au combat, un nouveau système de création d'objets permet aux joueurs de fabriquer des armes et des armures magiques en utilisant des matières premières trouvées au cours de leurs voyages. Comme auparavant, deux héros peuvent rejoindre l'aventure en mode coopératif sur le même écran, chaque personnage différant par les types de dons et de pouvoirs sous ses ordres. L'équipement peut être trouvé ou acheté auprès des marchands locaux en utilisant l'or récupéré sur les créatures abattues ou reçu en paiement de quêtes. Baldur's Gate : Dark Alliance II propose également un certain nombre de zones cachées, de personnages secrets et littéralement des centaines d'objets à trouver et à utiliser, notamment des potions, des parchemins et des baguettes. De plus, le jeu propose un nouveau scénario à embranchements qui offre aux joueurs le choix de la prochaine destination pour la fortune et l'honneur.