Le jeu se fait via une interface pointer-cliquer. Les joueurs doivent visiter divers endroits de la ville fictive de Harvest, ce qui peut être fait via une carte aérienne. En parlant à divers habitants de la ville et en cliquant sur des « points chauds » spéciaux, les joueurs peuvent apprendre des informations et collecter des objets qui font progresser l'histoire et le jeu du jeu. Harvester propose également un système de combat où les joueurs peuvent attaquer d'autres personnages en sélectionnant une arme puis en cliquant sur la cible. La cible et le personnage du joueur ont une quantité limitée de santé disponible, permettant au joueur ou à la cible de mourir. Les joueurs peuvent choisir de progresser dans le jeu en résolvant des énigmes ou en tuant l'un des personnages non jouables.