Cerberus a attaqué Eden Prime et s'est emparé d'une colonie humaine. Les forces de l'Alliance sont trop épuisées pour combattre les Faucheurs et sont incapables d'offrir leur soutien. Intel indique que Cerberus recherche un artefact prothéen et l'a trouvé. Shepard doit infiltrer la colonie et récupérer l'artefact. From Ashes comprend un nouveau membre puissant et permanent de l’équipe – le dernier Prothéen survivant. Apprenez-en davantage sur les derniers jours de l’empire prothéen, avant que les Faucheurs n’anéantissent leur race. From Ashes comprend également une nouvelle arme, le fusil à particules prothéenne, et de nouvelles apparences pour chaque membre de l'équipe.